Od dnia 1 grudnia 2010 r. wartość gwarancji depozytów wszystkich członków SKOK została zwiększona do kwoty stanowiącej równowartość 100 000 EURO. Oznacza to, że członkowie SKOK będą mieć gwarancję zwrotu 100 % swoich depozytów do tej wysokości, a ich pieniądze są chronione w takim samym stopniu, co depozyty ulokowane w bankach.

Zwiększenie wartości depozytów przez TUW SKOK, związane jest z wdrożeniem dyrektywy 2009/14/WE Parlamentu Europejskiego i Rady z dnia 11 marca 2009 r. zmieniającej dyrektywę 94/19/WE w sprawie systemów gwarancji depozytów w odniesieniu do poziomu gwarancji oraz terminu wypłaty.

Depozyty złożone w Spółdzielczych Kasach Oszczędnościowo - Kredytowych są chronione przez Program Ochrony Depozytów Spółdzielczych Kas Oszczędnościowo - Kredytowych.
Na program ten składają się dwa elementy: fundusz stabilizacyjny, tworzony ze składek płaconych przez wszystkie kasy, będący w dyspozycji Krajowej Spółdzielczej Kasy Oszczędnościowo - Kredytowej (KSKOK), oraz ubezpieczenie depozytów oferowane przez Towarzystwo Ubezpieczeń Wzajemnych Spółdzielczych Kas Oszczędnościowo - Kredytowych (TUW SKOK).

KSKOK w maju 1998 r., na podstawie ustawy o Spółdzielczych Kasach Oszczędnościowo-Kredytowych ustaliła normę dopuszczalnego ryzyka dotyczącą bezpieczeństwa środków pieniężnych zgromadzonych przez członków SKOK, która nakłada na każdą ze SKOK obowiązek ubezpieczenia oszczędności każdego członka Kasy.

TUW SKOK jest towarzystwem ubezpieczeniowym podlegającym nadzorowi Komisji Nadzoru Finansowego. Od 2007 roku TUW SKOK podobnie jak Bankowy Fundusz Gwarancyjny jest członkiem EFDI - European Forum of Deposit Insurers, organizacji zrzeszającej instytucje zajmujące się gwarantowaniem depozytów w krajach europejskich.

Spółdzielcze kasy w Polsce od początku swojego istnienia budują własny system ochrony oszczędności. Jednym z celów Krajowej Spółdzielczej Kasy Oszczędnościowo - Kredytowej jest ochrona oszczędności złożonych przez członków SKOK-ów. Dla jego realizacji został sformułowany Program Ochrony Oszczędności. Celem Programu jest zapewnienie bezpiecznego i solidnego funkcjonowania wszystkich SKOK-ów w Polsce poprzez efektywny nadzór, lustracje oraz programy naprawczo - stabilizacyjne dla zapobiegania trudnościom finansowym i upadłościom kas. W ramach Programu oszczędności członków SKOK są objęte ubezpieczeniem do wysokości 100 000 EURO. Zastosowanie tego ubezpieczenia oznacza, że oszczędności w kasach spółdzielczych zostały objęte ochroną równoważną do gwarancji depozytów.

Program Ochrony Oszczędności, obejmujący wszystkie SKOK-i, realizowany jest przez dwie instytucje. Pierwszą z nich jest Kasa Krajowa, która na mocy ustawy z dnia 14 grudnia 1995 r. o spółdzielczych kasach oszczędnościowo - kredytowych (Dz.U. z 1996 r. Nr 1, poz. 2) spełnia funkcje nadzorcze (w tym także związku rewizyjnego), funkcje stabilizujące (w oparciu o fundusz stabilizacyjny tworzony z wkładów SKOK-ów) oraz utrzymania płynności (funkcja kasy centralnej). W ramach sprawowanego przez siebie nadzoru, Kasa Krajowa między innymi ustala normy dopuszczalnego ryzyka w działalności kas, przeprowadza lustrację kas, dokonuje kontroli ich działalności w trybie nadzoru, ustala wymogi kwalifikacyjne dla członków zarządów kas, posiada możliwość zakazania prowadzenia działalności określonego rodzaju oraz wzywania do usunięcia stwierdzonych uchybień i zawieszenia zarządu. W kasach, w których występuje groźba zaprzestania spłacania długów, lub których działalność wykazuje rażące lub uporczywe naruszanie przepisów prawa, Kasa Krajowa może zawiesić działalność kasy ustanawiając zarządcę komisarycznego. Te oraz inne jeszcze uprawnienia ustawowe wraz z możliwościami finansowymi funduszu stabilizacyjnego, który wynosi obecnie 1% aktywów SKOK, dobrze chronią system przed niewypłacalnością. Jednakże kompletny system chroniący oszczędności powinien składać się z dwóch komponentów: pierwszy koncentruje się na zapobieganiu ryzykom i programach naprawczych (w przypadku SKOK-ów jest to funkcja stabilizacyjna) natomiast drugi obejmuje wypłatę depozytów (do określonego poziomu) w przypadku upadłości.

Drugą zatem instytucją wchodzącą w skład systemu bezpieczeństwa oszczędności w kasach spółdzielczych jest Towarzystwo Ubezpieczeń Wzajemnych SKOK, które - poczynając od maja 1998 roku - ubezpiecza oszczędności zgromadzone w SKOK-ach.

Na podstawie art. 35 pkt 5 ustawy o s.k.o.k. Kasa Krajowa ustaliła normę dopuszczalnego ryzyka dotyczącą bezpieczeństwa środków pieniężnych zgromadzonych przez członków SKOK-ów, wprowadzając z dniem 01.05.1998 r. obowiązek posiadania przez SKOK-i ubezpieczenia tych środków.

Realizując swoje obowiązki wynikające z ustawy oraz statutu, SKOK- i wprowadzają w życie dobrą praktykę zarządzania, działają zgodnie z zasadami spółdzielczych kas oszczędnościowo - kredytowych i kodeksem etycznym, jednolitymi procedurami świadczenia usług i prowadzenia kontrola. Kasy realizują indywidualne programy budowy kapitału i zarządzania ryzykiem oraz tworzą niezbędne rezerwy, w tym szczególnie na poczet pożyczek i kredytów przeterminowanych. Władze kas stale podnoszą swoje kwalifikacje w celu zapewnienia najwyższej jakości kadry zarządzającej.

Kasa Krajowa utrzymuje także zasoby finansowe na potrzeby wzajemnego kredytowania dla SKOK-ów mających problemy z płynnością. W sytuacji wyjątkowej, zagrożona utratą płynności kasa może zaciągnąć pożyczkę (kredyt) by sprostać popytowi na fundusze. Ta funkcja KSKOK pomaga SKOK-om zaspokoić potrzeby ich członków w zakresie pożyczek i wycofywania oszczędności.

System SKOK w Polsce należy zatem rozpatrywać jako całość złożoną z wzajemnie się uzupełniających elementów, których celem jest realizacja ustawowych zadań kas i Kasy Krajowej.